Les décisions nécessaires à la gestion et à l'administration de l'association sont adoptées et suivies par le Conseil d'administration ; celui-ci est constitué de quatre à dix membres représentatifs de l'Industrie élus par l'ensemble des adhérents de l'association parmi les membres du collège des Industriels.

Elle est réalisée par un cabinet d’expert comptable et contrôlée par un commissaire aux comptes au moins une fois par an. Les bilans et comptes de résultats sont, après leur approbation par les conseils et l’assemblée générale,  déposés annuellement à la préfecture du département.

Les activités sont exécutées par l'équipe de permanents de l'Institut dirigée par le directeur de l'association. Celui-ci reporte régulièrement auprès du Conseil d'administration. L'équipe peut être complétée par des étudiants pour des projets particuliers avec l'accord préalable et impératif du client s'il s'agit d'un projet industriel.

Il est l'organe de contrôle permanent de la gestion de l'association par le Directoire ; Il s'assure, en particulier, de la conformité à l'objet de l'association des décisions de politique générale prises par le Conseil d'administration.

Le Conseil de surveillance est constitué de membres du collège des partenaires ; Il est présidé par un représentant d'une des collectivités locales soutenant l'action de l'Institut.